Probability and Biological Evolution
Probabilités et évolution biologique
25 – 29 June 2018

Scientific Committee
Comité scientifique

Alison Etheridge (Oxford University)
Steven Evans (University of California, Berkeley)
Amaury Lambert (Université Pierre et Marie Curie)
Sylvie Méléard (Ecole polytechnique)
John Wakeley (Harvard University)

Organizing Committee
Comité d’organisation

Etienne Pardoux (Aix-Marseille Université)
Anton Wakolbinger (​Goethe Universität, Frankfurt)

Methods from probability theory and mathematical statistics are playing an increasingly important role in the analysis and explanation of phenomena in biological evolution, and conversely the latter continue to be a constant source of inspiration for the development of fascinating new probabilistic models. The CIRM 2018 conference on Probability and Biological Evolution
will bring new progress in these synergistic activities.

The themes of the meeting will be:
– Evolution of structured populations in genetics and ecology.
– Gene trees, species trees and the origins of biodiversity.
– Random genealogies in interaction: selection, competition, recombination.
– Viral and bacterial evolution; cancer modeling and tumor growth.
The meeting will bring together distinguished experts at the interface of probability theory and evolutionary biology, and thus will excellently fit into
the “Year of Mathematical Biology 2018”,

Les méthodes issues des probabilités et de la statistique jouent un rôle croissant dans l’analyse et l’explication des phénomènes liés à l’évolution biologique. Dans l’autre sens, celle-ci est une source d’inspiration pour de
nouveaux modèles probabilistes. La Conférence CIRM 2018 sur «Probabilités et Evolution Biologique» sera l’occasion de nouveaux progrès dans ces synergies.
Les thèmes de la conférence seront :
– Evolution de populations structurées en génétique et en écologie.
– Arbres de gènes, arbres d’espèces et les origines de la biodiversité.
– Généalogies aléatoires: sélection, compétition, recombinaisons.
– Evolution des virus et des bactéries; modélisation du cancer et croissance
La Conférence rassemblera des experts à l’interface des probabilités et de
l’évolution biologique, et sera un événement de «l’Année de la Biologie Mathématique 2018»

Ellen Baake (Universität Bielefeld)    A probabilistic view on the deterministic mutation-selection equation  (pdf)
Vincent Bansaye (École Polytechnique, Palaiseau)   Functional responses and interactions via a renewal approach  (pdf)
Nick Barton  (IST Austria) & Alison Etheridge (University of Oxford)     Establishment in a new habitat by polygenic adaptation (pdf)   VIDEO 
 Matthias Birkner (Johannes-Gutenberg-Universität, Mainz)   A conditional coalescent limit in fixed pedigrees   (pdf)
Jochen Blath  (TU Berlin)   Seed bank models in population genetics  (pdf)
Anton Bovier  (Universität Bonn)   Stochastic individual based models with application to modelling of cancer therapy  (pdf)
Nicolas Champagnat  (Université de Lorraine, Site de Nancy)   A large deviations approach to Hamilton-Jacobi scaling limits of PDE models of adaptive evolution of quantitative traits   (pdf)
Yu-Ting Chen (University of Tennessee, Knoxville)   Mean-field diffusions in stochastic spatial death-birth models   (pdf)
Camille Coron (Université Paris-Sud)    Demography, extinction and genetics   (pdf)
Steve N. Evans (University of California, Berkeley)    Inference from allele frequency time series   (pdf)
Fabian Freund (Universtät Hohenheim)   Multiple-merger coalescents – extended models, inference methods & evidence  (pdf)
Stephen Kissler (Queen’s College Cambridge)   Human mobility and strain dynamics   (pdf)
Katia Koelle (Emory University)   Using genetic data at multiple scales to understand constraints on viral adaptation    (pdf)
Amaury Lambert (Université Paris 6)   Ranked Tree Shapes and the Future Loss of Phylogenetic Diversity   (pdf)
Julia Adela Palacios (Stanford University)   State-space exploration of Tajima’s Trees   (pdf)
Peter Pfaffelhuber (Albert-Ludwigs University of Freiburg)   A two-locus model with interacting mutation rates and fluctuating selection   (pdf)
Cornelia Pokalyuk (Goethe- University Frankfurt am Main)   ​Maintenance of diversity in a parasite population capable of persistence and reinfection   (pdf)
Emmanuel Schertzer (Université Paris 6)  Coagulation-transport PDE and nested coalescent   (pdf)
Sebastian Schreiber (University of California, Davis)    Population persistence & diversity maintenance in fluctuating environments   (pdf)
Jason Schweinsberg (University of California, San Diego)   Rigorous results for a population model with selection    (pdf)
Mike Steel (University of Canterbury)   Deciphering a species phylogeny from conflicting gene tre
(pdf)   VIDEO 
Viet Chi Tran  (Université des Sc. et Technologies de Lille)   Stochastic dynamics of a population of microorganisms with competition and horizontal  transfers (pdf)
Amandine Véber (École Polytechnique, Palaiseau)   How to make good resolutions   VIDEO 
John Wakeley (Harvard University)   The Evolution of Cooperation in an Iterated Survival Game   (pdf)   VIDEO