Scientific Commitee
Comité scientifique
Juan Cortés (CNRS, LAAS Toulouse)
Charles H. Robert (CNRS, LBT Paris)
Frédéric Cazals (INRIA Sophia-Antipolis)
Organizing Commitee
Comité d’organisation
Isaure Chauvot de Beauchene (CNRS, LORIA Nancy)
Samuela Pasquali (BFA, Université Paris-Cité)
Yann Ponty (CNRS, Ecole polytechnique)
IMPORTANT WARNING: Scam / Phishing / SMiShing ! Note that ill-intentioned people may be trying to contact some of participants by email or phone to get money and personal details, by pretending to be part of the staff of our conference center (CIRM). CIRM and the organizers will NEVER contact you by phone on this issue and will NEVER ask you to pay for accommodation/ board / possible registration fee in advance. Any due payment will be taken onsite at CIRM during your stay.
The proposed School is the 11th occurence of the successful AlgoSB school, whose broad goal is to bring together worldwide experts in computer science, applied mathematics, computational biology/chemistry and physics in a pleasant setting amenable to learning new approaches and creating synergies for future work.
Leading researchers from institutes around the world are invited to provide lectures together with hands-on practical courses, to disseminate best practices, share multidisciplinary perspectives and expose the audience to open, well-defined algorithmic and mathematical questions in structural bioinformatics. A fundamental goal of the school is to facilitate an algorithmic view of these ideas in order to identify new research directions.
This year, the focus of AlgoSB 2025 is “Structure modeling and design towards RNA-based therapeutics“. The program will dedicate each day to a specific subtopic in RNA Bioinformatics. Morning sessions will be dedicated to lectures on the theoretical foundations of each topic, introducing key-concepts and algorithms in the context of modern biology. These introductory lectures will be followed by advanced lectures on more focused topics, then by sessions of practical
coursework on personal laptops.
The AlgoSB school is open to senior and junior scientists, from academia and industry, as well as PhD students and postdocs, wishing to integrate new theoretical approaches and methodologies into their research or to extend them in new directions.
L’école proposée est la 11e édition de l’école AlgoSB, dont l’objectif général est de réunir des experts mondiaux en informatique, en mathématiques appliquées, en biologie/chimie informatique et en physique dans un cadre agréable, propice à l’apprentissage de nouvelles approches et à la création de synergies pour les travaux futurs.
Des chercheurs de premier plan issus d’instituts du monde entier sont invités à donner des conférences ainsi que des cours pratiques, afin de diffuser les meilleures pratiques, de partager des perspectives pluridisciplinaires et d’exposer le public à des questions algorithmiques et mathématiques ouvertes et bien définies dans le domaine de la bioinformatique structurale. L’un des objectifs fondamentaux de l’école est de faciliter une vision algorithmique de ces idées afin d’identifier de nouvelles directions de recherche.
Cette année, AlgoSB 2025 porte sur modélisation et la conception de structures pour les thérapies basées sur l’ARN. Le programme consacrera chaque jour à un sous-thème spécifique de la bioinformatique de l’ARN. Les sessions du matin seront consacrées à des conférences courtes sur les fondements théoriques de chaque sujet, introduisant les concepts clés et les algorithmes dans le contexte de la biologie moderne. Ces conférences introductives seront suivies par des conférences avancées sur des sujets plus ciblés, puis par des sessions de travaux pratiques sur des ordinateurs portables personnels.
L’école AlgoSB est ouverte aux scientifiques seniors et juniors, issus du monde universitaire et de l’industrie, ainsi qu’aux doctorants et aux postdocs, qui souhaitent intégrer de nouvelles approches théoriques et méthodologies dans leurs recherches ou les étendre dans de nouvelles directions.
LECTURES
From sequence to 2D structure
Ivo Hofacker (TBI Vienna)
From sequence to 3D structure
Marcin Magnus (Harvard University)
Modeling RNA-ion interactions
Elise Duboué-Dijon (LBT, CNRS, Paris)
Algorithms for RNA design
Sebastian Will (LIX, Ecole Polytechnique)
Modeling RNA-protein interactions
Kalli Kappel (UCLA, Los Angeles)
Integrative RNA modeling
SAXS and MD simulations: Liuba Mazzanti (BioCIS, Université Paris-Saclay)
SHAPE probing: Ivo Hofacker (TBI Vienna)
RNA-based Therapeutics and Biotechnology
Michael Wolfinger (University of Vienna)
SPONSORS
